A Secretaria Municipal de Saúde de São Caetano de Odivelas atua como gestora local do Sistema Único de Saúde (SUS), sendo responsável pela elaboração e manutenção de políticas de saúde, além de planejar, promover e normatizar ações de proteção da saúde no município.
Como peça fundamental desta estratégia de atendimento de Urgência e Emergência, há o projeto federal SAMU 192 (Serviço Móvel de Urgência), que realiza atendimentos 24h, agindo no socorro de pacientes vítimas de acidentes ou em situações clínicas que ofereçam risco eminente à vida humana.
Atualmente o município conta com 04 ESFs, 04 Postos de Saúde, 1 Unidades de Saúde, que realizam atendimentos urgência de baixa complexidade e atuam na atenção básica à saúde, com consultas ambulatoriais previamente agendadas. Além destes serviços, também prestam assistência à população por meio de programas de saúde, como Hiperdia (Hipertensão e Diabetes), Academia da Saúde, PSE, saúde do idoso, pré-natal, e outros. A SMS do município conta também com 01 Laboratório e 01 Clinica de Fisioterapia, que funcionam na Unidade Mista de Saúde e estão à disposição da população. E com o intuito de Ampliar os serviços oferecidos e aproximando a população dos serviços públicos de saúde, a SMS/SCO gerencia Unidades Saúde da Família, programa do Governo Federal, levando serviços de saúde a todas as localidades.
O Departamento de Vigilância em Saúde da SMS/SCO, além de coordenar campanhas de imunização, desenvolve ações focadas na prevenção, monitoramento e combate de doenças como dengue, malária, meningite, esquistossomose, leishmaniose e doença de chagas. E também coordena os serviços ofertados pelo Centro de Controle de Zoonoses, que trabalha no combate e prevenção de qualquer doença passível de ser transmitida por animais ao homem, como a leptospirose e a raiva. A SMS/SCO conta também com o Departamento de Vigilância Sanitária, que vistoria as condições higiênico-sanitárias, de atuação profissional e dos serviços oferecidos por estabelecimentos comerciais como: empresas, hotéis, restaurantes e bares.